Qualquer composto orgânico, colorido, geralmente chamado de tintura, usada para manchar tecidos, células, componentes celulares ou conteúdo de célula. o corante pode ser naturais ou sintéticos. o objeto manchado é chamado substrato. o pequeno tamanho e a transparência dos microorganismos tornam difícil ver mesmo com o auxílio de um microscópio de alta potência. Coloração facilita a observação de um substrato, introduzindo diferenças em densidade óptica ou absorção da luz entre o substrato e seu surround ou entre diferentes partes do mesmo substrato. Em microscopia eletrônica de varredura e às vezes em microscopia de luz (como a técnica de impregnação de prata de coloração de flagelos ou cápsulas), coloração é realizada mediante depósito de partículas ultraphotoscopic substrato de um metal como cromo ou ouro (o chamado processo de sombreamento); ou a coloração é feita por tratar o substrato com soluções de compostos metálicos tais como o ácido de acetato ou fosfotúngstico uranilo. Este tipo de coloração não é tratado neste artigo.