1) Campo que utiliza sequências de proteínas, expressão e estrutura para determinar como as proteínas se relacionam, interagem e funcionar em um organismo; inclui caracterizando e catalogação de proteínas e bibliotecas de proteína, comparando as variações nos níveis de expressão de proteínas em condições diferentes, estudando as interações da proteína e funções funcionais; as técnicas são executadas de forma automatizada, grande escala; pode também envolver a análise de bioinformatic e armazenamento de dados.

2) O estudo sistemático do complemento total de proteínas (proteoma) dos organismos.

3) Um ramo de biotecnologia em causa a aplicação de técnicas de biologia molecular, bioquímica e genética para analisar a estrutura, função e interações das proteínas produzidas por genes de uma determinada célula, tecido ou organismo, com organizando as informações em bancos de dados e com aplicações dos dados (como na medicina ou biologia).

4) O estudo dos genes, suas proteínas resultantes e o papel desempenhado pelas proteínas processos bioquímicos do corpo.