Um sistema fisiologicamente interativo, dentro do qual crescimento, adaptação, composição de espécies, ciclos de nutrientes, produtividade biológica e fluxos de energia entre interior aquático microbiano, plantaram e comunidades animais são integradas com o meio ambiente. Estas águas interiores incluem lagos, reservatórios, rios, córregos e áreas úmidas. a disciplina denominada Limnologia avalia como essas relações regulam e estão regulamentadas pela, naturais e antropogénicas variações nos ambientes físicos, químicos e bióticos. Lago (lentic) a água parada ou ecossistema do reservatório está intimamente acoplada com a terra na sua área de drenagem circundante e com suas águas executando (lóticos) que alteram os componentes químicos da terra como eles são transportados para o lago. Muitas vezes a interface terra-água suporta produtivas das zonas húmidas, isto é, áreas de águas rasas, muitas vezes encontrado na beira de Lagos (litoral) ou ao longo dos rios (Várzea).