Uma técnica para a determinação da seqüência de base de um polinucleotido homogênea que age como um modelo em um sistema de replicação. A pequena quantidade de trifosfato de dideoxynucleoside específico está incluída com os quatro triphosphates do deoxynucleotide normal durante a replicação. Cadeia terminação ocorre sempre que um dideoxynucleotide é incorporado que gera um polinucleotido rotulado cujo comprimento chain, avaliado por eletroforese em gel de poliacrilamida, indica a distância entre a extremidade 5' do primer para a posição em que o nucleotídeo normal ocorre. Deteção da electroforese bandas podem ser por um rótulo como ³² P ou, mais recentemente, por um fluoróforo incorporado o primer (sequenciamento de corante primário) ou o dideoxynucleotide (sequenciamento de dye terminator). Na verdade, uma variação do método dye terminator, a rotulagem de todos os quatro dideoxynucleotides com um fluoróforo que emite em um autorizações diferentes comprimento de onda, a identificação da base que encerra cada electroforese banda dentro uma mistura separada de todos os quatro (simples seqüenciamento de pista).